Vinculado à Pró-Reitoria de Pós Graduação, Pesquisa e Extensão, o Comitê de Ética em Pesquisa do UNASP é um colegiado que garante que as pesquisas realizadas pela instituição estejam de acordo com as propostas de diretrizes éticas internacionais. Compete regulamentar, analisar e fiscalizar a realização de pesquisa envolvendo seres humanos, seguindo as propostas de diretrizes éticas internacionais. Também possui um Comitê de Ética para Estudos com Animais, conforme a Diretriz Brasileira para o Cuidado e a Utilização de Animais para Fins Científicos e Didáticos – DBCA.